Student's talk - Molecular Biology - Final Schedule

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Iscrivetevi in ciascuno slot temporale, a gruppi di 2 studenti, con un max di 4 gruppi per giorno (5 solo proprio in casi "disperati").
Nella casella di destra indicate il titolo del lavoro scelto e se possibile il link.
Vi consiglio di prenotare lo slot temporale "prima" di avere scelto il lavoro: nello stesso tempo, mettete il lavoro appena lo avete scelto, per evitare che altri scelgano lo stesso.
Gli argomenti principali:
1) microarrays di espressione e RNA Seq - qualsiasi situazione sperimentale, purchè il lavoro descriva con dovuta ampiezza il tipo di analisi, i risultati e, soprattutto, la funzione dei risultati ovvero l'interpretazione ed applicazione.
2) modificazioni epigenetiche, eucromatina ed eterocromatina, studi genome-wide sulla localizzazione di geni, promotori, sequenze silenti o trascritte, isolatori, elementi funzionali di vario tipo.
3) Studi genome-wide sullo splicing alternativo e sulla sua regolazione in qualsiasi modello sperimentale.
4) noncoding RNA: studi di enumerazione e di funzione collettiva. MicroRNA, siRNA, piRNA, long-noncoding RNA.
5) Regolazione trascizionale: fattori di trascrizione, coattivatori, corepressori, studi genome-wide di funzione, ChIP-chip e ChIp-Seq.
6) Regolazione post-trascrizionale: regolazione stabilità mRNA, localizzazione mRNA, proteine leganti RNA sempre con profilo genome-wide.
Si raccomandano Riviste primarie e ultimi due anni (2009 e 2010).
Nature
Nature Cell Biology
Nature Genetics
Science
Cell
Molecular Cell
Genes & Development
PLOS Biology (NO: PLOS One)
PNAS (proc Natl Acad Sci US)
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Student's talk - Biology

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Modified: 5 January 2011, 9:30 PM   User: Cimino Irene  → 

Date
group
title
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Sta tus
Wed. Dec 15, 4pm
Gho - Bovio
Modulation of miRna processing by p53
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OK

Mana - Morano
Reversible Block of Mouse Neural Stem Cell Differentiation in the Absence of Dicer and MicroRNAs
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OK

Martina - Gigliotti

The honey bee epigenomes: differential methylation of brain DNA in queens and workers


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OK

Joffrain - Biolatti
The human cytomegalovirus microRNA miR-UL112 acts synergistically with a cellular microRNA to escape immune elimination LINK to paper
OK
Fri. Dec 17, 11am
Nigro - Marzanati
A Methyl tranferase links the circadian clock to the regulation of alternative splicing LINK to paper OK

Ferrero-Ruvolo
 
     
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OK

Bonetto-Magi

A Pilot Study of Circulating miRNAs as Potential Biomarkers of Early Stage Breast Cancer
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OK
Mon. Dec 20, 11am Ceolato-Galliani
Epigenetic memory in induced pluripotent stem cells
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OK

Gullà-Arizzi
Characterization of RNA content of chromatin
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OK
Mon. Jan 10, 11am
Collino-Minuzzo
A dicer-independent miRNA biogenesis pathway that requires Ago catalysis
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OK

Alessandria-Orlandi
Discovering hematopoietic mechanisms through Genome-wide analysis of GATA factor chromatin occupancy Link to Paper
OK

disponibile
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Tuesday Jan 11 (9am)
Bernardini - Sarasso Real-time DNA sequencing from single polymerase molecules LINK to paper OK
B.I.

Cerutti-Gandini

TRIM24 links a non-canonical histone signature to breast cancer
Link to paper OK

Enrico - Vaccari
Small regulatory RNAs inhibit RNA Polymerase II during the elongation phase of transcription
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OK

Cerri
Paternally induced transgenerational environmental reprogramming of metabolic gene expression in mammals Link to paper OK
Wed. Jan 12, 4 pm
Riganò-Bellomo

Long non-coding RNAs with enhancer-like function

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OK

Cati-Ambrogio Striatal microRNA controls cocaine intake throught CREB signalling http://www.nature.com/nature/journal/v466/n7303/full/nature09202.html ???

Cimino
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Thursday Jan 13 (2 PM)
DeRose-Lunardelli
Reciprocal intronic and exonic histone modification regions in humans LINK to paper OK
B.I.
De Angelis-Villarroel RNA sequencing shows no dosage compensation of the active x-chromosome LINK to paper OK

Tatullo Vergnano

Regulation of alternative splicing by histone modification
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OK

Giacone - Tafur
Heterochromatin silencing of p53 target genes by a small viral protein
LINK to paper OK
Mon. Jan 17, 11am
Torta-Carrara
Genetic regulation of immune response mediated by Bcl-6 and NF-kB LINK to paper OK

Andrione-Falcomatà
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Brossa-Girardi
Trasfection of shRNA-encoding Minivector DNA of a few hundred base pairs to regulate gene expression in lymphoma cells http://www.nature.com/gt/journal/vaop/ncurrent/full/gt2010123a.html ???

Astesana-Cavalera
Methyl-binding protein mediates gene silencing and promotes tumour cell motility and invasion
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OK
Wed. Jan 19, 4pm Piretta-Moiso Scrivete qui un titolo riassuntivo (no copia e incolla:altererà la tabella) Per inserire il link a fianco: selezionate la scritta "LINK to paper" nella casella a destra, quindi cliccate il simbolo del link nel banner in alto (la catena accanto all'ancora), appare una finestrella in cui incollate l'URL, quindi inventate un breve titolo e chiudete.
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LINK to paper ???

Antonazzo A novel pathway regulates memory and plasticity via SIRT-1 and miR-134
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Pozzi-Scalzitti
An alternative splicing network links cell-cycle control to apoptosis.
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OK

Vitiello - Agnesod

Short RNAs are transcribed from repressed Polycomb Target Genes and interact with Polycomb Repressive Complex-2;

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OK
Fri. Jan 21, 11 am
Scandurra - Monteleone
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De Rosa -Castagno Targeted inibition of miRNA maturation with morpholinos reveals a role for miR-375 in pancreatic islet development. Link to paper OK

Plicato-Testore
A genome-wide RNAi screen reveals determinants of human embryonic stem cell identity LINK to paper
OK

Campolo- Baravalle
Intronic miR-211 Assumes the Tumor Suppressive Function of Its Host Gene in Melanoma Link to paper