Student's talk - Molecular Biology - Final Schedule
Per favore PRIMA di editare, leggete le informazioni "Subjects for Student talks",
NOTA: Per inserire i vostri dati in Tabella: per favore seguite le istruzioni!
Iscrivetevi in ciascuno slot temporale, a gruppi di 2 studenti, con un max di 4 gruppi per giorno (5 solo proprio in casi "disperati").
Nella casella di destra indicate il titolo del lavoro scelto e se possibile il link.
Vi consiglio di prenotare lo slot temporale "prima" di avere scelto il lavoro: nello stesso tempo, mettete il lavoro appena lo avete scelto, per evitare che altri scelgano lo stesso.
Gli argomenti principali:
1) microarrays di espressione e RNA Seq - qualsiasi situazione sperimentale, purchè il lavoro descriva con dovuta ampiezza il tipo di analisi, i risultati e, soprattutto, la funzione dei risultati ovvero l'interpretazione ed applicazione.
2) modificazioni epigenetiche, eucromatina ed eterocromatina, studi genome-wide sulla localizzazione di geni, promotori, sequenze silenti o trascritte, isolatori, elementi funzionali di vario tipo.
3) Studi genome-wide sullo splicing alternativo e sulla sua regolazione in qualsiasi modello sperimentale.
4) noncoding RNA: studi di enumerazione e di funzione collettiva. MicroRNA, siRNA, piRNA, long-noncoding RNA.
5) Regolazione trascizionale: fattori di trascrizione, coattivatori, corepressori, studi genome-wide di funzione, ChIP-chip e ChIp-Seq.
6) Regolazione post-trascrizionale: regolazione stabilità mRNA, localizzazione mRNA, proteine leganti RNA sempre con profilo genome-wide.
Si raccomandano Riviste primarie e ultimi due anni (2009 e 2010).
Nature
Nature Cell Biology
Nature Genetics
Science
Cell
Molecular Cell
Genes & Development
PLOS Biology (NO: PLOS One)
PNAS (proc Natl Acad Sci US)
per altri giornali chiedere
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Vi consiglio di prenotare lo slot temporale "prima" di avere scelto il lavoro: nello stesso tempo, mettete il lavoro appena lo avete scelto, per evitare che altri scelgano lo stesso.
Gli argomenti principali:
1) microarrays di espressione e RNA Seq - qualsiasi situazione sperimentale, purchè il lavoro descriva con dovuta ampiezza il tipo di analisi, i risultati e, soprattutto, la funzione dei risultati ovvero l'interpretazione ed applicazione.
2) modificazioni epigenetiche, eucromatina ed eterocromatina, studi genome-wide sulla localizzazione di geni, promotori, sequenze silenti o trascritte, isolatori, elementi funzionali di vario tipo.
3) Studi genome-wide sullo splicing alternativo e sulla sua regolazione in qualsiasi modello sperimentale.
4) noncoding RNA: studi di enumerazione e di funzione collettiva. MicroRNA, siRNA, piRNA, long-noncoding RNA.
5) Regolazione trascizionale: fattori di trascrizione, coattivatori, corepressori, studi genome-wide di funzione, ChIP-chip e ChIp-Seq.
6) Regolazione post-trascrizionale: regolazione stabilità mRNA, localizzazione mRNA, proteine leganti RNA sempre con profilo genome-wide.
Si raccomandano Riviste primarie e ultimi due anni (2009 e 2010).
Nature
Nature Cell Biology
Nature Genetics
Science
Cell
Molecular Cell
Genes & Development
PLOS Biology (NO: PLOS One)
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Student's talk - Biology
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Modified: 16 January 2011, 5:28 PM User: De Bortoli Michele →
Date |
group |
title |
link to paper - status |
Sta tus |
|
Wed. Dec 15, 4pm |
Gho - Bovio | Modulation of miRna processing by p53 | LINK to paper |
OK |
|
Mana - Morano |
Reversible Block of Mouse Neural Stem Cell Differentiation in the Absence of Dicer and MicroRNAs |
LINK to paper |
OK |
||
Martina - Gigliotti |
The honey bee epigenomes: differential methylation of brain DNA in queens and workers |
LINK to paper |
OK |
||
Joffrain - Biolatti |
The human cytomegalovirus microRNA miR-UL112 acts synergistically with a cellular microRNA to escape immune elimination | LINK to paper |
OK |
||
Fri. Dec 17, 11am |
Nigro - Marzanati |
A Methyl tranferase links the circadian clock to the regulation of alternative splicing | LINK to paper | OK |
|
Ferrero-Ruvolo |
LINK to paper |
OK |
|||
Bonetto-Magi |
A Pilot Study of Circulating miRNAs as Potential Biomarkers of Early Stage Breast Cancer |
LINK to paper |
OK |
||
Mon. Dec 20, 11am | Ceolato-Galliani |
Epigenetic memory in induced pluripotent stem cells |
LINK to paper |
OK |
|
Gullà-Arizzi |
Characterization of RNA content of chromatin |
|
OK |
||
Mon. Jan 10, 11am |
Collino-Minuzzo |
A dicer-independent miRNA biogenesis pathway that requires Ago catalysis |
Link to paper |
OK |
|
Alessandria-Orlandi |
Discovering hematopoietic mechanisms through Genome-wide analysis of GATA factor chromatin occupancy | Link to Paper |
OK |
||
Tue Jan 11 (9am) |
Bernardini - Sarasso | Real-time DNA sequencing from single polymerase molecules | LINK to paper | OK |
|
B.I. |
Cerutti-Gandini |
TRIM24 links a non-canonical histone signature to breast cancer |
Link to paper | OK |
|
Enrico - Vaccari |
Small regulatory RNAs inhibit RNA Polymerase II during the elongation phase of transcription |
Link to paper |
OK |
||
Wed. Jan 12, 4 pm |
Riganò-Bellomo |
Long non-coding RNAs with enhancer-like function |
OK |
||
Cati-Ambrogio |
Striatal microRNA controls cocaine intake throught CREB signalling |
OK |
|||
Cimino-Schimenti |
Coordinate control of gene expression noise and interchromosomal interactions in a MAP kinase pathway | Link to paper | OK |
||
Thu Jan 13 (2 PM) |
DeRose-Lunardelli |
Reciprocal intronic and exonic histone modification regions in humans | LINK to paper | OK |
|
B.I. |
De Angelis-Villarroel | RNA sequencing shows no dosage compensation of the active x-chromosome | LINK to paper | OK |
|
Tatullo Vergnano |
Regulation of alternative splicing by histone modification |
LINK to paper |
OK |
||
Giacone - Tafur |
Heterochromatin silencing of p53 target genes by a small viral protein |
LINK to paper | OK |
||
Mon. Jan 17, 11am |
Torta-Carrara |
Genetic regulation of immune response mediated by Bcl-6 and NF-kB | LINK to paper | OK |
|
Brossa-Girardi |
Trasfection of shRNA-encoding Minivector DNA of a few hundred base pairs to regulate gene expression in lymphoma cells | link to paper | ??? |
||
Astesana-Cavalera |
Methyl-binding protein mediates gene silencing and promotes tumour cell motility and invasion |
LINK to paper |
OK |
||
Wed. Jan 19, 4pm | Piretta-Moiso | A gene expression signature associated with "K-Ras addiction" reveals regulators of EMT and tumor cell survival | LINK to paper | ??? |
|
Antonazzo | A novel pathway regulates memory and plasticity via SIRT-1 and miR-134 |
LINK to paper | +/- |
||
Pozzi-Scalzitti |
An alternative splicing network links cell-cycle control to apoptosis. |
LINK to paper |
OK |
||
Vitiello - Agnesod |
Short RNAs are transcribed from repressed Polycomb Target Genes and interact with Polycomb Repressive Complex-2; |
OK |
|||
Fri. Jan 21, 11 am |
Scandurra - Monteleone |
Anti-tumor activity of splice-switching oligonucleotides |
link to paper | ??? |
|
De Rosa -Castagno | Targeted inibition of miRNA maturation with morpholinos reveals a role for miR-375 in pancreatic islet development. | Link to paper | OK |
||
Plicato-Testore |
A genome-wide RNAi screen reveals determinants of human embryonic stem cell identity | LINK to paper |
OK |
||
Campolo- Baravalle |
Association of Tat with Promoters of PTEN and PP2A Subunits is Key of Transcriptional Activation of Apoptotic Pathways in HIV-Infected CD4+ T Cells | Link to paper |
|||
Truno di recupero (presumib. lunedì 24) | Perino |
Alternative splicing regulation during C. Elegans development: Splicing factor as regulated targets | Link to paper | ||
Cerri |
Paternally induced transgenerational environmental reprogramming of metabolic gene expression in mammals | Link to paper | |||
Andrione-Falcomatà | The histone H3K36 MT MES-4 acts epigenetically to transmit memory of germline gene expression to progeny | Link to paper | |||
Bocchero |
Scrivete qui un titolo riassuntivo (no copia e incolla:altererà la tabella) Per inserire il link a fianco: selezionate la scritta "LINK to paper" nella casella a destra, quindi cliccate il simbolo del link nel banner in alto (la catena accanto all'ancora), appare una finestrella in cui incollate l'URL, quindi inventate un breve titolo e chiudete. Cancellate queste istruzioni per inserire il vostro titolo |
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